在云澳镇著园村东面山腰。原名三宝寺。面南近海，始建于宋。因山上常有云气笼罩，改名云盖寺。寺旁曾有巨石题刻“紫云华盖”四字。明朝后期，海寇经常侵扰，寺院、石刻皆被毁。清道光年间重建庵寺。清代深澳贡生范之齐题“云盖寺”石匾立于庵寺正门。1987年潮籍海外黄檗宗高僧释定因、帷一、帷坚等筹资重修。释定因题额“紫云华盖”悬挂中厅，中国佛教协会会长赵朴初题书柱联“愿祈佛力舒千臂，不舍鱼龙集众材”。著名高僧、中国佛协常务理事、汕头佛协会长释定持于1962年于云盖寺题诗云：“古寺观音现座禅，茂林修竹景天然。千声梵赞歌南海，万点渔火朝宝莲。绿水无边红日浴，青山半壁白云眠。妙香夜月弄珠影，岛屿如花散佛前。”此诗把云盖寺依山傍海的美丽景致点染无遗。南澳八景之一的“古寺晴云”中之古寺，就是云盖寺。云盖寺是南澳创建年代最早的庵寺。据原深澳关帝庙的一通碑刻“南澳镇城汉寿亭侯祠记”记载，明嘉靖四十四年(1565)戚继光破吴平，就是暗地里“从澳之云盖寺”间道从背后奇袭，一举歼灭贼寇而大获全胜的。故云盖寺又是南澳影响较大的庵寺之一。寺平面为四合院式布局，主体建筑硬山顶，抬梁式梁架构筑，面积约300平方米。