位于鄠县东南四十里的圭峰山北麓。后秦弘始三年(401年)西域高僧鸠摩罗什来长安，先住逍遥园，后移住于此，因造一堂，以草覆苫，故名草堂寺。鸠摩罗什在此讲经十余年，并与沙门翻译大量佛经，引入三论学说。弘始十五年(413年)鸠摩罗什圆寂，骨灰即葬于此寺。唐代时于宪宗元和(806～820年)中、穆宗长庆元年(821年)、宣宗大中九年(855年)多次重修，并改名栖禅寺。五代后梁开平(907～911年)年间重修时，已称清凉建福院，然草堂、栖禅之名亦继续沿用。后经宋乾德四年(966年)、金明昌四年(1193年)、元至正二十六年(1366年)多次修葺。明洪武十六年(1383年)建该寺为僧会司。明代以来，该寺为佛教禅宗临济派重要道场。清雍正十二年(1734年)敕封该寺僧肇为大智圆正圣僧禅师，并易寺名为圣恩寺，但人仍习称草堂寺。乾隆三十一年(1766年)寺僧寂法再次募资重修。宋元明清以来，草堂寺以其千年名刹、寺院竹林葱郁、门外诸峰苍翠、景色如画而闻名，游人不绝，多有题咏。宋程颢《题草堂》诗云：“参差台殿绿云中，四面筼筜一径通。曾读华阳《真诰》上，神仙居在碧琳宫。”元溥光《题草堂》诗云：“草堂名刹岁年深，三藏谈经事莫寻。惟有千章云木在，风来犹作海潮音。”明正德十五年(1520年)王九思《游南山记》云：草堂寺“寺基宽敞，前殿壁画甚古”。万历四十六年(1618年)赵崡《游城南》亦云：“草堂寺，今名栖禅寺，有鸠摩罗什舍利石塔，精殊甚，宋人作亭覆之，今尚在。傍有龙井，云与高观潭相通，未知的否·”清同治元年(1862年)与光绪七年(1881年)该寺因遭兵火的焚毁与洪水的破坏，殿宇几成丘墟。后虽重修，但甚简陋。解放后，人民政府先后拨款整修五次，殿宇一新，渐恢规模。现寺占地约四十亩，有大殿、回廊、僧房四十多间。山门内道旁钟楼，有明万历十九年(1591年)铸造的一口大铁钟，重一万斤。西边亭内有著名的《唐故圭峰定慧禅师传法碑》，立于唐大中九年(855年)，系唐代宰相书法家裴休撰书，柳公权篆额。书法秀丽，辞句流畅，为世所重，金赵秉文有《游草堂寺》诗五首，其一云：“下马未寻题壁字，拂尘先读草堂壁。平生最爱圭峰志，惟有裴公无愧词。”二道门内是用红砖围成的四合头大院，上有大殿，两侧有厢房。二道门两侧护壁走廊上镶嵌着二十一块碑石，为宋、金、元、明、清各代文人题诗及修庙碑记。大殿前高悬“逍遥三屋”的横匾，殿中有如来佛金身塑像。并安放着日本友人赠送的鸠摩罗什楠木雕像，大殿西侧门外不远，有一座砖筑花墙围绕的六角护塔亭，亭中立着“姚秦三藏法师鸠摩罗什舍利塔”。塔高2．6米，八面十二级，由西域所贡的玉白、砖青、墨黑、乳黄、淡黄、浅蓝、赭紫及灰色等八种颜色的大理石镶砌而成，故称“八宝玉石塔”。塔身有浮雕纹饰和阴刻佛像，形式别致，雕刻精美。塔北竹林掩映处有一座古亭，亭中央有一古井，每到秋冬之晨，水气升腾，缭绕草堂之上，积雾蒙蒙，人称“烟雾井”，“草堂烟雾”亦成为明清时期著名的“关中八景”之一。现草堂寺为省级重点文物保护单位。